加盟金和特许权使用费的设计是特许权组合设计的精髓，加盟金的体现的是特许人所拥有的品牌、专利、经营技术诀窍、经营模式、商誉等无形资产的价值，而特许权使用费体现的是特许人在受许人的经营活动中多拥有的权益。

(1)加盟金的设计。如果将特许权组合视为特许人的产品，那么加盟金的本质就是特许权组合的价格，加盟金的设计就是制定特许权组合的价格。

加盟金的设计合理与否主要取决于三大因素：特许权组合的开发成本及市场价值、区域权益的价值和时间权益的价值。

加盟金收取的方式有以下三种：一是在签订特许经营合同时一次收齐;二是将加盟金的总额除以特许经营合同的年限，计算出平均加盟金的数额后，按年收取;三是不收加盟金。某些特许人，特别是那些品牌知名度很低的特许人在特许经营体系发展的初期采用免加盟费或只收取少量特许权使用费的方式来吸引投资人加盟。

(2)特许权使用费的设计。特许权使用费的本质是一种管理费，类似于租用或购买公寓每月要交纳物业管理费。