在特许经营的运作过程中，未经授权的第三人专利侵权和特许经营体系内部的专利侵权时有发生。一般来说，对特许人的专利侵权行为主要包括以下几种形式：

第一，未经特许人许可的第三人实施其专利。

特许人获得专利后，除法律规定的情形如专利实施的强制许可外，任何第三人都不得未经特许人授权实施其专利，即不得为生产经营目的制造、使用、许诺销售、销售、进口其专利产品，或者为使用其专利方法以及使用、许诺销售、销售、进口依据该专利方法直接获得的产品，以及为当地知识产权法所禁止的平行进口行为。

第二，第三人假冒特许人专利。

假冒特许人专利包括：(1)未经过许可，在其制造或销售的产品、产品包装上标注特许人的专利号;(2)未经许可，在合同、广告或者其他宣传材料中使用特许人的专利号，使人将所涉及的技术误认为是特许人的专利技术;(3)伪造或者变造特许人的专利证书、专利文件。

第三，受许人侵犯特许人的专利权的行为。

受许人除了可能通过以上两种方式侵犯特许人的专利权外，主要可以通过违反与特许人签订的专利许可使用协议的规定来侵犯特许人的专利权。如未经特许人同意，超越专利许可使用协议规定的地域范围、期限、方式使用特许商标;擅自将专利权通过再许可方式许可他人使用谋取利益;将特许人许可使用的专利用于与特许经营活动无关的其他领域。